卧虎藏龙的故事背景设定在清朝光绪年间，这一历史时期的社会风貌为游戏提供了丰富的叙事土壤。新疆总兵玉瑞镇守边关十二年，其女玉娇龙自幼习武，师从高朗秋，暗中练就一身超群武艺。游戏主线围绕玉娇龙盗取青冥剑展开，牵扯出李慕白、俞秀莲等江湖人物的恩怨情仇，同时映射了清末社会变革下传统礼教与个人自由的冲突。历史细节如九门提督、雄远镖局等设定均符合清代官僚体系和民间组织特征。
游戏通过玉娇龙这一角色深刻展现了封建家族制度对女性的束缚。玉娇龙不满父亲安排的婚事，因与新疆大盗罗小虎私定终身而反抗家族权威，这一情节揭示了清末社会新旧思想的碰撞。游戏中的武当派、丐帮等门派设定延续了明清时期江湖帮派的组织结构，而轻功、剑法等武学系统则融合了传统武术文化与艺术夸张表现。玉娇龙在无名古坟获得九华剑拳全书的奇遇设定，借鉴了清代民间话本中武林秘籍的传承方式。
游戏对历史场景的还原具有考究之处。从京城鼓楼西大街的正黄旗驻地到德胜门外的土城战场，地理坐标均参照清代北京城布局。玉府宅院、铁贝勒府等建筑呈现了清代贵族府邸的规制，而市井街巷中的镖局、茶肆则还原了晚清商业生态。游戏道具如八仙桌、雕花椅等器物符合明清家具特征，角色服饰中李慕白的长袍与俞秀莲的包裹式衣装体现了清代汉人着装规范，与罗小虎的西域装扮形成鲜明对比。
剧情核心冲突源于江湖道义与封建礼法的矛盾。李慕白欲退隐江湖却因师仇重返纷争，玉娇龙追求自由却陷于家族责任，这些人物弧光折射出清末社会转型期的精神困境。游戏通过碧眼狐狸等反派角色，隐喻了传统江湖秩序的崩坏。最终玉娇龙跳崖的结局并非简单悲剧，而是对封建桎梏的极致反抗，这种叙事手法继承了清代侠义小说侠情悲剧的文学传统。
轻功系统参考了清代手臂录等武学典籍记载的提纵术，门派任务中的押镖、缉盗等玩法还原了清代镖局的实际职能。游戏将历史事件如新疆匪患作为背景设定，但未直接表现具体史实，这种虚实结合的手法既保持了武侠作品的浪漫特质，又锚定了具体历史坐标。玩家通过跑商、帮派战等玩法，能间接感受到清末地方治理体系与民间自治力量的微妙关系。