大本营升级是玩家发展的核心环节，但伴随而来的隐患往往被忽视。速本策略虽然能快速解锁高级舰船和功能，却容易导致资源分配失衡。前期过度依赖动员令加速建筑升级，可能造成金属、晶体等基础资源储备不足，进而影响中期舰船生产线和矿车部署效率。部分玩家在未充分规划资源产出建筑时盲目升本，会陷入高本低产的被动局面，甚至因资源短缺被迫停滞发展。
大本营等级提升后，舰船数量和质量的需求激增，但若未同步优化舰队配置，将面临战力断层。速本至八本后若未能及时研发或获取战巡、航母等高阶舰船蓝图，仅依靠低级护卫舰和驱逐舰难以应对七级以上野怪或敌对玩家侵袭。军事港口和生产线等级若未跟上大本营节奏，会导致舰船生产速度滞后，进一步削弱防御与扩张能力。这种虚高的基地等级反而会成为战略弱点。
随着大本营升级，玩家虽能解锁更多计划圈，但若缺乏对矿点分布和战略要地的合理规划，会导致资源采集效率低下或防御漏洞。六本后未及时部署中级采矿平台，仍依赖初级平台和小型工程舰，会因采集速率不足而拖慢整体发展。计划圈若过度分散于边缘区域，可能因曲率航行距离过长而延误战术响应，尤其在遭遇突袭时难以快速集结舰队。
社交与同盟协作的不足也会放大隐患。高等级大本营需要更多同盟支援，例如联合攻打资源合成工厂或建立前哨站，但若玩家单方面追求速本而未融入同盟协作体系，将难以获取关键资源或防御支援。城防升级若被忽视，即便基地等级领先，也可能因防御设施薄弱成为敌对势力优先攻击目标。这种孤立发展模式在后期大规模星系争夺战中尤为不利。
任何一方面的滞后都可能引发连锁反应，导致发展停滞或战略被动。玩家需在速本与稳健发展间找到适配自身节奏的路径，避免陷入高本低效的陷阱。